Với quy mô sinh viên đang trên đà tăng trưởng cả về chất và lượng, đầy sức trẻ và nhiệt huyết, Trường Đại học Việt Nhật hiện đào tạo 7 chuyên ngành đào tạo Đại học: Nhật Bản học, Khoa học và kỹ thuật máy tính, Kỹ thuật xây dựng, Nông nghiệp thông minh và bền vững, Công nghệ thực phẩm và sức khỏe, Cơ điện tử thông minh và sản xuất theo phương thức Nhật Bản, Trung tâm giáo dục tiếng Nhật; và 8 chuyên ngành đạo tạo Thạc sỹ: Khu vực học, Quản trị kinh doanh, Biến đổi khí hậu và phát triển, Kỹ thuật xây dựng, Kỹ thuật môi trường, Công nghệ Nano, Chính sách công, Lãnh đạo toàn cầu.